Il enseigne l’histoire contemporaine allemande ainsi que l’histoire mise en regard avec le cinéma (Université Paris-Sorbonne (Paris IV)
Il consacre ses travaux à l’histoire de la culture nazie, notamment dans son essai intitulé Le national-socialisme et l’Antiquité. Spécialiste d’histoire politique et culturelle, Johann Chapoutot utilise le cinéma comme une source importante de recherche.